Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MTA1Q13330 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTA1Q13330 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTA1Q13330 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTA1Q13330 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTA1Q13330 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTA1Q13330 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MTA1Q13330 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTA1Q13330 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTA1Q13330 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTA1Q13330 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTA1Q13330 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTA1Q13330 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MTA1Q13330 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MTA1Q13330 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTA1Q13330 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA1Q13330 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA1Q13330 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MTA1Q13330 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms