Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATMQ13315 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATMQ13315 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATMQ13315 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATMQ13315 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATMQ13315 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATMQ13315 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATMQ13315 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATMQ13315 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATMQ13315 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATMQ13315 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATMQ13315 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATMQ13315 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATMQ13315 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATMQ13315 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATMQ13315 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATMQ13315 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATMQ13315 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
ATMQ13315 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATMQ13315 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATMQ13315 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATMQ13315 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATMQ13315 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATMQ13315 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATMQ13315 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATMQ13315 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATMQ13315 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATMQ13315 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATMQ13315 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATMQ13315 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATMQ13315 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATMQ13315 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATMQ13315 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATMQ13315 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATMQ13315 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATMQ13315 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATMQ13315 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATMQ13315 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATMQ13315 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATMQ13315 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATMQ13315 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATMQ13315 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATMQ13315 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATMQ13315 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATMQ13315 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATMQ13315 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATMQ13315 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATMQ13315 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATMQ13315 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATMQ13315 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATMQ13315 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATMQ13315 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATMQ13315 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMQ13315 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMQ13315 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATMQ13315 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMQ13315 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATMQ13315 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATMQ13315 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATMQ13315 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATMQ13315 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATMQ13315 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMQ13315 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATMQ13315 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMQ13315 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMQ13315 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMQ13315 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATMQ13315 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMQ13315 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMQ13315 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMQ13315 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMQ13315 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMQ13315 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATMQ13315 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMQ13315 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMQ13315 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATMQ13315 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATMQ13315 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMQ13315 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMQ13315 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMQ13315 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATMQ13315 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMQ13315 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMQ13315 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMQ13315 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMQ13315 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATMQ13315 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATMQ13315 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATMQ13315 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMQ13315 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
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