Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
GRIN2BQ13224 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
GRIN2BQ13224 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
GRIN2BQ13224 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.05■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
GRIN2BQ13224 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.98■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
GRIN2BQ13224 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
GRIN2BQ13224 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
GRIN2BQ13224 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
GRIN2BQ13224 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
GRIN2BQ13224 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
GRIN2BQ13224 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
GRIN2BQ13224 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
GRIN2BQ13224 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
GRIN2BQ13224 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
GRIN2BQ13224 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
GRIN2BQ13224 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
GRIN2BQ13224 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
GRIN2BQ13224 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
GRIN2BQ13224 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
GRIN2BQ13224 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
GRIN2BQ13224 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GRIN2BQ13224 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GRIN2BQ13224 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
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