Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PAPPAQ13219 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PAPPAQ13219 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PAPPAQ13219 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PAPPAQ13219 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PAPPAQ13219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
PAPPAQ13219 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PAPPAQ13219 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PAPPAQ13219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PAPPAQ13219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PAPPAQ13219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PAPPAQ13219 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms