Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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