Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN2Q12907 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMAN2Q12907 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN2Q12907 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN2Q12907 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMAN2Q12907 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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