Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH17Q12864 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH17Q12864 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH17Q12864 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH17Q12864 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH17Q12864 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH17Q12864 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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