Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPTFQ12830 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BPTFQ12830 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPTFQ12830 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPTFQ12830 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BPTFQ12830 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BPTFQ12830 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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