Protein–RNA interactions for Protein: Q12387

MDM20, N-terminal acetyltransferase B complex subunit MDM20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM20Q12387 THI72YOR192C 1800 nt10.21□□□□□ -0.78
MDM20Q12387 UGA4YDL210W 1716 nt10.2□□□□□ -0.78
MDM20Q12387 YAT1YAR035W 2064 nt10.19□□□□□ -0.78
MDM20Q12387 PAR32YDL173W 888 nt10.17□□□□□ -0.78
MDM20Q12387 YMR262WYMR262W 942 nt10.14□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 QDR2YIL121W 1629 nt10.14□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 UTR1YJR049C 1593 nt10.13□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 POP2YNR052C 1302 nt10.1□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 HSL7YBR133C 2484 nt10.1□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 SED1YDR077W 1017 nt10.1□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
MDM20Q12387 TUB4YLR212C 1422 nt10.08□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 YER152W-AYER152W-A 567 nt10.07□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 CSM1YCR086W 573 nt10.05□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 GSF2YML048W 1212 nt10.05□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 LSB5YCL034W 1065 nt10.05□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 GAL3YDR009W 1563 nt10.05□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 YCP4YCR004C 744 nt10.03□□□□□ -0.8
MDM20Q12387 POT1YIL160C 1254 nt10.02□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 YJL118WYJL118W 660 nt10.02□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 SAM35YHR083W 990 nt10.01□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 RIB7YBR153W 735 nt10.01□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 SNZ1YMR096W 894 nt10□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 LIP1YMR298W 453 nt10□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 MHF1YOL086W-A 273 nt10□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 SAM50YNL026W 1455 nt9.98□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 BUD20YLR074C 501 nt9.97□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 RPT5YOR117W 1305 nt9.97□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 MEP3YPR138C 1470 nt9.97□□□□□ -0.81
MDM20Q12387 APS2YJR058C 444 nt9.96□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 YPL251WYPL251W 303 nt9.96□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 NUC1YJL208C 990 nt9.95□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 HIF1YLL022C 1158 nt9.95□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 SPT20YOL148C 1815 nt9.94□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 YMR103CYMR103C 363 nt9.94□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 KRE1YNL322C 942 nt9.93□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 YPR126CYPR126C 309 nt9.92□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 BRR1YPR057W 1026 nt9.91□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 RPC82YPR190C 1965 nt9.9□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 CTI6YPL181W 1521 nt9.9□□□□□ -0.82
MDM20Q12387 SAM3YPL274W 1764 nt9.89□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 SSN3YPL042C 1668 nt9.89□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 IGD1YFR017C 588 nt9.88□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 NIF3YGL221C 867 nt9.88□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 PRM5YIL117C 957 nt9.87□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 TOA2YKL058W 369 nt9.87□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 INA1YLR413W 2028 nt9.87□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 IML3YBR107C 738 nt9.86□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 YCR025CYCR025C 411 nt9.85□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 BNI5YNL166C 1347 nt9.84□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 LEU9YOR108W 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 YBL086CYBL086C 1401 nt9.84□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 ACO2YJL200C 2370 nt9.84□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 PHO23YNL097C 993 nt9.84□□□□□ -0.83
MDM20Q12387 TPS1YBR126C 1488 nt9.82□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.81□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.81□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 DAK2YFL053W 1776 nt9.81□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 HXT1YHR094C 1713 nt9.81□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 DBP1YPL119C 1854 nt9.81□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 HEL2YDR266C 1920 nt9.8□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 YNL024CYNL024C 741 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 IPL1YPL209C 1104 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 GND2YGR256W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 MSC1YML128C 1542 nt9.77□□□□□ -0.84
MDM20Q12387 SWM1YDR260C 513 nt9.77□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 OYE2YHR179W 1203 nt9.76□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.76□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 RIM8YGL045W 1629 nt9.75□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 LYS20YDL182W 1287 nt9.74□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 RAS2YNL098C 969 nt9.74□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 RPL12BYDR418W 498 nt9.72□□□□□ -0.85
MDM20Q12387 SAM2YDR502C 1155 nt9.71□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 YOR343CYOR343C 327 nt9.71□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 SEC61YLR378C 1443 nt9.71□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 YMR007WYMR007W 381 nt9.7□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 MUP1YGR055W 1725 nt9.7□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 EAF3YPR023C 1206 nt9.69□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 RCR1YBR005W 642 nt9.68□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 OXA1YER154W 1209 nt9.67□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.67□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 YER188WYER188W 720 nt9.66□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 CDD1YLR245C 429 nt9.66□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 PAU21YOR394W 495 nt9.66□□□□□ -0.86
MDM20Q12387 PAU22YPL282C 495 nt9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 408.4 ms