Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1BQ0VAM2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1BQ0VAM2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASGEF1BQ0VAM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms