Protein–RNA interactions for Protein: Q0P140

HSD52, Putative uncharacterized protein HSD52, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD52Q0P140 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD52Q0P140 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD52Q0P140 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD52Q0P140 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD52Q0P140 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD52Q0P140 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSD52Q0P140 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HSD52Q0P140 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD52Q0P140 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD52Q0P140 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD52Q0P140 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD52Q0P140 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD52Q0P140 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD52Q0P140 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD52Q0P140 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms