Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IFFO1Q0D2I5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFFO1Q0D2I5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFFO1Q0D2I5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFFO1Q0D2I5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFFO1Q0D2I5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFFO1Q0D2I5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFFO1Q0D2I5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms