Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP4Q09028 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP4Q09028 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP4Q09028 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP4Q09028 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP4Q09028 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP4Q09028 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms