Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf4Q06507 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf4Q06507 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf4Q06507 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf4Q06507 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf4Q06507 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf4Q06507 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf4Q06507 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf4Q06507 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf4Q06507 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf4Q06507 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms