RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000164574.1

Snrpe-202, Transcript of Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Snrpe, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54.98■■■■■ 6.39
Snrpe-202ENSMUST00000164574 NischQ80TM9 1593 aa53.92■■■■■ 6.22
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Abcc9P70170 1546 aa52.59■■■■■ 6.01
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Abcc8B2RUS7 1588 aa52.51■■■■■ 6
Snrpe-202ENSMUST00000164574 ScribQ80U72 1612 aa51.24■■■■■ 5.79
Snrpe-202ENSMUST00000164574 NacadQ5SWP3 1504 aa49.49■■■■■ 5.51
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Kdm5dQ62240 1548 aa49.3■■■■■ 5.48
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa48.69■■■■■ 5.38
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48.61■■■■■ 5.37
Snrpe-202ENSMUST00000164574 BicraF8VPZ9 1578 aa48.13■■■■■ 5.29
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48.01■■■■■ 5.28
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46.91■■■■■ 5.1
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46.3■■■■■ 5
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Baz1aO88379 1555 aa46.22■■■■■ 4.99
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46.18■■■■■ 4.98
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa46.16■■■■■ 4.98
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Rhox8Q6VSS7 320 aa46■■■■■ 4.95
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45.87■■■■■ 4.93
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Fam135aQ6NS59 1506 aa45.67■■■■■ 4.9
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45.64■■■■■ 4.9
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45.36■■■■■ 4.85
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45.2■■■■■ 4.83
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45.18■■■■■ 4.82
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45.17■■■■■ 4.82
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Dnajc5P60904 198 aa45.06■■■■■ 4.8
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Baz1bQ9Z277 1479 aa45.05■■■■■ 4.8
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44.92■■■■■ 4.78
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Mrc2Q64449 1479 aa44.63■■■■■ 4.73
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Trim41Q5NCC3 630 aa44.49■■■■■ 4.71
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44.27■■■■■ 4.68
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Rtl1Q7M732 1744 aa43.96■■■■■ 4.63
Snrpe-202ENSMUST00000164574 CftrP26361 1476 aa43.88■■■■■ 4.61
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43.76■■■■■ 4.6
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43.64■■■■■ 4.58
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Synj1Q8CHC4 1574 aa43.6■■■■■ 4.57
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cux2P70298 1426 aa43.45■■■■■ 4.55
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Shroom2A2ALU4 1481 aa43.23■■■■■ 4.51
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Kif15Q6P9L6 1387 aa43.22■■■■■ 4.51
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43.19■■■■■ 4.5
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43.11■■■■■ 4.49
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Col17a1Q07563 1470 aa42.91■■■■■ 4.46
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42.75■■■■■ 4.43
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cep164Q5DU05 1446 aa42.63■■■■■ 4.41
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Plb1Q3TTY0 1478 aa42.55■■■■■ 4.4
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Top2bQ64511 1612 aa42.42■■■■■ 4.38
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Il27Q8K3I6 234 aa42.23■■■■■ 4.35
Snrpe-202ENSMUST00000164574 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ccdc18Q640L5 1455 aa42.12■■■■■ 4.33
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Crocc2F6XLV1 1638 aa42.07■■■■■ 4.33
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Rusc2Q80U22 1514 aa42.05■■■■■ 4.32
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ift140E9PY46 1464 aa42.01■■■■■ 4.32
Snrpe-202ENSMUST00000164574 TnnQ80Z71 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
Snrpe-202ENSMUST00000164574 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Camsap1A2AHC3 1581 aa41.84■■■■■ 4.29
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa41.84■■■■■ 4.29
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Golga3P55937 1487 aa41.83■■■■■ 4.29
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Disp1Q3TDN0 1521 aa41.65■■■■■ 4.26
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Duox2A2AQ99 1517 aa41.6■■■■■ 4.25
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cngb1E1AZ71 1325 aa41.56■■■■■ 4.24
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Adgrl3Q80TS3 1537 aa41.52■■■■■ 4.24
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Fmn1Q05860 1466 aa41.47■■■■■ 4.23
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa41.47■■■■■ 4.23
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41.44■■■■■ 4.22
Snrpe-202ENSMUST00000164574 PtprkP35822 1457 aa41.36■■■■■ 4.21
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Gm156Q58A37 223 aa41.36■■■■■ 4.21
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa41.36■■■■■ 4.21
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Grin2bQ01097 1482 aa41.25■■■■■ 4.19
Snrpe-202ENSMUST00000164574 PtprtQ99M80 1454 aa41.24■■■■■ 4.19
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Cep170Q6A065 1588 aa41.23■■■■■ 4.19
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa41.22■■■■■ 4.19
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Fgd6Q69ZL1 1399 aa41.2■■■■■ 4.19
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Samd9lQ69Z37 1561 aa41.2■■■■■ 4.19
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41.16■■■■■ 4.18
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Efcab5A0JP43 1406 aa41.08■■■■■ 4.17
Snrpe-202ENSMUST00000164574 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41.04■■■■■ 4.16
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Grin2aP35436 1464 aa40.97■■■■■ 4.15
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40.93■■■■■ 4.14
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
Snrpe-202ENSMUST00000164574 AknaQ80VW7 1404 aa40.84■■■■■ 4.13
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Abcc1O35379 1528 aa40.83■■■■■ 4.13
Snrpe-202ENSMUST00000164574 Pprc1Q6NZN1 1644 aa40.82■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.9 ms