RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211888.1

Pard6a-203, Transcript of Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pard6a, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54,87■■■■■ 6,37
Pard6a-203ENSMUST00000211888 NischQ80TM9 1593 aa53,75■■■■■ 6,2
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Abcc9P70170 1546 aa52,49■■■■■ 5,99
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,27■■■■■ 5,96
Pard6a-203ENSMUST00000211888 ScribQ80U72 1612 aa51,16■■■■■ 5,78
Pard6a-203ENSMUST00000211888 NacadQ5SWP3 1504 aa49,24■■■■■ 5,47
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Kdm5dQ62240 1548 aa49,15■■■■■ 5,46
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa48,53■■■■■ 5,36
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,37■■■■■ 5,33
Pard6a-203ENSMUST00000211888 BicraF8VPZ9 1578 aa48■■■■■ 5,28
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47,73■■■■■ 5,23
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46,81■■■■■ 5,08
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,78■■■■■ 5,08
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,7■■■■■ 5,07
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa46,11■■■■■ 4,97
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46,05■■■■■ 4,96
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Baz1aO88379 1555 aa45,95■■■■■ 4,95
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45,8■■■■■ 4,92
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,71■■■■■ 4,91
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45,66■■■■■ 4,9
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45,6■■■■■ 4,89
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Rhox8Q6VSS7 320 aa45,52■■■■■ 4,88
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,49■■■■■ 4,87
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,47■■■■■ 4,87
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,3■■■■■ 4,84
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,24■■■■■ 4,83
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45■■■■■ 4,79
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45■■■■■ 4,79
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45■■■■■ 4,79
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,91■■■■■ 4,78
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Dnajc5P60904 198 aa44,8■■■■■ 4,76
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,71■■■■■ 4,75
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,59■■■■■ 4,73
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,51■■■■■ 4,72
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Trim41Q5NCC3 630 aa44,51■■■■■ 4,72
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Mrc2Q64449 1479 aa44,43■■■■■ 4,7
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,68■■■■■ 4,58
Pard6a-203ENSMUST00000211888 CftrP26361 1476 aa43,63■■■■■ 4,57
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,6■■■■■ 4,57
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Synj1Q8CHC4 1574 aa43,52■■■■■ 4,56
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,32■■■■■ 4,53
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43,26■■■■■ 4,52
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cux2P70298 1426 aa43,24■■■■■ 4,51
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,12■■■■■ 4,49
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,03■■■■■ 4,48
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Shroom2A2ALU4 1481 aa42,96■■■■■ 4,47
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,94■■■■■ 4,46
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Rtl1Q7M732 1744 aa42,94■■■■■ 4,46
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42,92■■■■■ 4,46
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42,9■■■■■ 4,46
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,72■■■■■ 4,43
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Col17a1Q07563 1470 aa42,71■■■■■ 4,43
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,59■■■■■ 4,41
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,47■■■■■ 4,39
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42,45■■■■■ 4,39
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cep164Q5DU05 1446 aa42,4■■■■■ 4,38
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Top2bQ64511 1612 aa42,36■■■■■ 4,37
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,36■■■■■ 4,37
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,25■■■■■ 4,35
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP42,2■■■■■ 4,35
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Il27Q8K3I6 234 aa42,19■■■■■ 4,34
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,03■■■■■ 4,32
Pard6a-203ENSMUST00000211888 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41,94■■■■■ 4,3
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,93■■■■■ 4,3
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Rusc2Q80U22 1514 aa41,91■■■■■ 4,3
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41,85■■■■■ 4,29
Pard6a-203ENSMUST00000211888 TnnQ80Z71 1560 aa41,78■■■■■ 4,28
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ift140E9PY46 1464 aa41,78■■■■■ 4,28
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,75■■■■■ 4,27
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa41,73■■■■■ 4,27
Pard6a-203ENSMUST00000211888 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,59■■■■■ 4,25
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,5■■■■■ 4,23
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Duox2A2AQ99 1517 aa41,43■■■■■ 4,22
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,43■■■■■ 4,22
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa41,39■■■■■ 4,22
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Adgrl3Q80TS3 1537 aa41,36■■■■■ 4,21
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,32■■■■■ 4,21
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa41,32■■■■■ 4,21
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Golga3P55937 1487 aa41,27■■■■■ 4,2
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,19■■■■■ 4,18
Pard6a-203ENSMUST00000211888 PtprkP35822 1457 aa41,18■■■■■ 4,18
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,15■■■■■ 4,18
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Cep170Q6A065 1588 aa41,15■■■■■ 4,18
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Gm156Q58A37 223 aa41,14■■■■■ 4,18
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,14■■■■■ 4,18
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,11■■■■■ 4,17
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Grin2bQ01097 1482 aa41,06■■■■■ 4,16
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa41,06■■■■■ 4,16
Pard6a-203ENSMUST00000211888 PtprtQ99M80 1454 aa41,04■■■■■ 4,16
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Fmn1Q05860 1466 aa40,99■■■■■ 4,15
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,94■■■■■ 4,14
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,94■■■■■ 4,14
Pard6a-203ENSMUST00000211888 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,85■■■■■ 4,13
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Grin2aP35436 1464 aa40,81■■■■■ 4,12
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Efcab5A0JP43 1406 aa40,77■■■■■ 4,12
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,77■■■■■ 4,12
Pard6a-203ENSMUST00000211888 AknaQ80VW7 1404 aa40,76■■■■■ 4,11
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Pprc1Q6NZN1 1644 aa40,72■■■■■ 4,11
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Abcc1O35379 1528 aa40,7■■■■■ 4,11
Pard6a-203ENSMUST00000211888 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP40,64■■■■■ 4,1
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