RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000206570.1

Ppp4c-211, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ppp4c, Length 1,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55,44■■■■■ 6,47
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 NischQ80TM9 1593 aa54,66■■■■■ 6,34
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Abcc9P70170 1546 aa52,89■■■■■ 6,06
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,87■■■■■ 6,05
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 ScribQ80U72 1612 aa51,13■■■■■ 5,78
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 NacadQ5SWP3 1504 aa49,4■■■■■ 5,5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Kdm5dQ62240 1548 aa49,39■■■■■ 5,5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,54■■■■■ 5,36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,45■■■■■ 5,35
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 BicraF8VPZ9 1578 aa47,86■■■■■ 5,25
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47,67■■■■■ 5,22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rhox8Q6VSS7 320 aa47,13■■■■■ 5,13
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Baz1aO88379 1555 aa46,94■■■■■ 5,11
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,85■■■■■ 5,09
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46,71■■■■■ 5,07
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,66■■■■■ 5,06
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,45■■■■■ 5,03
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46,31■■■■■ 5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46,19■■■■■ 4,98
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46■■■■■ 4,95
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,62■■■■■ 4,89
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,57■■■■■ 4,88
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,52■■■■■ 4,88
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45,51■■■■■ 4,88
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,46■■■■■ 4,87
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,41■■■■■ 4,86
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,09■■■■■ 4,81
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45,03■■■■■ 4,8
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44,97■■■■■ 4,79
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rtl1Q7M732 1744 aa44,79■■■■■ 4,76
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,68■■■■■ 4,74
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,45■■■■■ 4,71
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,4■■■■■ 4,7
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 CftrP26361 1476 aa44,39■■■■■ 4,7
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44,39■■■■■ 4,7
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Synj1Q8CHC4 1574 aa44,36■■■■■ 4,69
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,3■■■■■ 4,68
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44,21■■■■■ 4,67
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44,14■■■■■ 4,66
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Mrc2Q64449 1479 aa44,03■■■■■ 4,64
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43,61■■■■■ 4,57
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,36■■■■■ 4,53
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Trim41Q5NCC3 630 aa43,34■■■■■ 4,53
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,32■■■■■ 4,52
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cux2P70298 1426 aa43,31■■■■■ 4,52
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,15■■■■■ 4,5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Lamc3Q9R0B6 1581 aa43,14■■■■■ 4,5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43,1■■■■■ 4,49
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,8■■■■■ 4,44
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Top2bQ64511 1612 aa42,68■■■■■ 4,42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cep164Q5DU05 1446 aa42,67■■■■■ 4,42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Golga3P55937 1487 aa42,65■■■■■ 4,42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 TnnQ80Z71 1560 aa42,65■■■■■ 4,42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cngb1E1AZ71 1325 aa42,53■■■■■ 4,4
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,51■■■■■ 4,4
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc18Q640L5 1455 aa42,47■■■■■ 4,39
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Il27Q8K3I6 234 aa42,46■■■■■ 4,39
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,4■■■■■ 4,38
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Camsap1A2AHC3 1581 aa42,39■■■■■ 4,38
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,37■■■■■ 4,37
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dnajc5P60904 198 aa42,29■■■■■ 4,36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,29■■■■■ 4,36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42,27■■■■■ 4,36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,23■■■■■ 4,35
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Fmn1Q05860 1466 aa42,19■■■■■ 4,34
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP42,04■■■■■ 4,32
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Shroom2A2ALU4 1481 aa41,97■■■■■ 4,31
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ift140E9PY46 1464 aa41,87■■■■■ 4,29
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Duox2A2AQ99 1517 aa41,85■■■■■ 4,29
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rusc2Q80U22 1514 aa41,8■■■■■ 4,28
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Grin2bQ01097 1482 aa41,77■■■■■ 4,28
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,58■■■■■ 4,25
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,58■■■■■ 4,25
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,54■■■■■ 4,24
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41,52■■■■■ 4,24
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,44■■■■■ 4,23
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Col17a1Q07563 1470 aa41,43■■■■■ 4,22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Efcab5A0JP43 1406 aa41,43■■■■■ 4,22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,42■■■■■ 4,22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,39■■■■■ 4,22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,39■■■■■ 4,22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41,35■■■■■ 4,21
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41,29■■■■■ 4,2
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,29■■■■■ 4,2
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 NrkQ9R0G8 1455 aa41,24■■■■■ 4,19
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Chic1Q8CBW7 227 aa41,2■■■■■ 4,19
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Grin2aP35436 1464 aa41,17■■■■■ 4,18
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Magi3Q9EQJ9 1476 aa41,17■■■■■ 4,18
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 PtprkP35822 1457 aa41,09■■■■■ 4,17
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Shroom4Q1W617 1475 aa41,08■■■■■ 4,17
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41,06■■■■■ 4,16
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP40,99■■■■■ 4,15
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 SynmQ70IV5 1561 aa40,93■■■■■ 4,14
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pla2r1Q62028 1487 aa40,92■■■■■ 4,14
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,89■■■■■ 4,14
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Gpatch8A2A6A1 1505 aa40,86■■■■■ 4,13
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Zeb1Q64318 1117 aa40,74■■■■■ 4,11
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 AknaQ80VW7 1404 aa40,68■■■■■ 4,1
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cep170Q6A065 1588 aa40,65■■■■■ 4,1
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40,64■■■■■ 4,1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,6 ms