RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032135.5

Rab43-202, Transcript of Ras-related protein Rab-43, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab43, Length 1,262 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43-202ENSMUST00000032135 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54,84■■■■■ 6,37
Rab43-202ENSMUST00000032135 NischQ80TM9 1593 aa53,67■■■■■ 6,18
Rab43-202ENSMUST00000032135 Abcc9P70170 1546 aa52,77■■■■■ 6,04
Rab43-202ENSMUST00000032135 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,29■■■■■ 5,96
Rab43-202ENSMUST00000032135 ScribQ80U72 1612 aa51,3■■■■■ 5,8
Rab43-202ENSMUST00000032135 NacadQ5SWP3 1504 aa49,34■■■■■ 5,49
Rab43-202ENSMUST00000032135 Kdm5dQ62240 1548 aa49,24■■■■■ 5,47
Rab43-202ENSMUST00000032135 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa49,07■■■■■ 5,45
Rab43-202ENSMUST00000032135 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,49■■■■■ 5,35
Rab43-202ENSMUST00000032135 BicraF8VPZ9 1578 aa48,15■■■■■ 5,3
Rab43-202ENSMUST00000032135 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47,71■■■■■ 5,23
Rab43-202ENSMUST00000032135 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP47,08■■■■■ 5,13
Rab43-202ENSMUST00000032135 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,88■■■■■ 5,1
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,68■■■■■ 5,06
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa46,33■■■■■ 5,01
Rab43-202ENSMUST00000032135 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46,2■■■■■ 4,99
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,87■■■■■ 4,93
Rab43-202ENSMUST00000032135 Baz1aO88379 1555 aa45,85■■■■■ 4,93
Rab43-202ENSMUST00000032135 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45,71■■■■■ 4,91
Rab43-202ENSMUST00000032135 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,69■■■■■ 4,9
Rab43-202ENSMUST00000032135 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,58■■■■■ 4,89
Rab43-202ENSMUST00000032135 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45,56■■■■■ 4,88
Rab43-202ENSMUST00000032135 Dnajc5P60904 198 aa45,48■■■■■ 4,87
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45,45■■■■■ 4,87
Rab43-202ENSMUST00000032135 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,32■■■■■ 4,85
Rab43-202ENSMUST00000032135 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,31■■■■■ 4,84
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rhox8Q6VSS7 320 aa45,24■■■■■ 4,83
Rab43-202ENSMUST00000032135 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45,13■■■■■ 4,82
Rab43-202ENSMUST00000032135 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45,11■■■■■ 4,81
Rab43-202ENSMUST00000032135 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP45,08■■■■■ 4,81
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45,03■■■■■ 4,8
Rab43-202ENSMUST00000032135 Trim41Q5NCC3 630 aa44,97■■■■■ 4,79
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,87■■■■■ 4,77
Rab43-202ENSMUST00000032135 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,78■■■■■ 4,76
Rab43-202ENSMUST00000032135 Mrc2Q64449 1479 aa44,65■■■■■ 4,74
Rab43-202ENSMUST00000032135 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,49■■■■■ 4,71
Rab43-202ENSMUST00000032135 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,85■■■■■ 4,61
Rab43-202ENSMUST00000032135 CftrP26361 1476 aa43,59■■■■■ 4,57
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,57■■■■■ 4,57
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,49■■■■■ 4,55
Rab43-202ENSMUST00000032135 Synj1Q8CHC4 1574 aa43,44■■■■■ 4,54
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cux2P70298 1426 aa43,35■■■■■ 4,53
Rab43-202ENSMUST00000032135 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43,33■■■■■ 4,53
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rtl1Q7M732 1744 aa43,32■■■■■ 4,53
Rab43-202ENSMUST00000032135 Shroom2A2ALU4 1481 aa43,32■■■■■ 4,52
Rab43-202ENSMUST00000032135 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP43,12■■■■■ 4,49
Rab43-202ENSMUST00000032135 Col17a1Q07563 1470 aa43,11■■■■■ 4,49
Rab43-202ENSMUST00000032135 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,08■■■■■ 4,49
Rab43-202ENSMUST00000032135 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42,97■■■■■ 4,47
Rab43-202ENSMUST00000032135 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42,8■■■■■ 4,44
Rab43-202ENSMUST00000032135 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,76■■■■■ 4,44
Rab43-202ENSMUST00000032135 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42,74■■■■■ 4,43
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42,67■■■■■ 4,42
Rab43-202ENSMUST00000032135 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,62■■■■■ 4,41
Rab43-202ENSMUST00000032135 Top2bQ64511 1612 aa42,6■■■■■ 4,41
Rab43-202ENSMUST00000032135 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,57■■■■■ 4,41
Rab43-202ENSMUST00000032135 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,5■■■■■ 4,39
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cep164Q5DU05 1446 aa42,46■■■■■ 4,39
Rab43-202ENSMUST00000032135 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP42,45■■■■■ 4,39
Rab43-202ENSMUST00000032135 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,34■■■■■ 4,37
Rab43-202ENSMUST00000032135 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa42,19■■■■■ 4,34
Rab43-202ENSMUST00000032135 Il27Q8K3I6 234 aa42,19■■■■■ 4,34
Rab43-202ENSMUST00000032135 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP42,13■■■■■ 4,33
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rusc2Q80U22 1514 aa42,06■■■■■ 4,32
Rab43-202ENSMUST00000032135 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,06■■■■■ 4,32
Rab43-202ENSMUST00000032135 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41,99■■■■■ 4,31
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,89■■■■■ 4,3
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ift140E9PY46 1464 aa41,87■■■■■ 4,29
Rab43-202ENSMUST00000032135 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa41,72■■■■■ 4,27
Rab43-202ENSMUST00000032135 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,7■■■■■ 4,27
Rab43-202ENSMUST00000032135 TnnQ80Z71 1560 aa41,7■■■■■ 4,27
Rab43-202ENSMUST00000032135 Adgrl3Q80TS3 1537 aa41,64■■■■■ 4,26
Rab43-202ENSMUST00000032135 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,63■■■■■ 4,26
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa41,61■■■■■ 4,25
Rab43-202ENSMUST00000032135 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,52■■■■■ 4,24
Rab43-202ENSMUST00000032135 Duox2A2AQ99 1517 aa41,43■■■■■ 4,22
Rab43-202ENSMUST00000032135 PtprkP35822 1457 aa41,41■■■■■ 4,22
Rab43-202ENSMUST00000032135 Gm156Q58A37 223 aa41,38■■■■■ 4,21
Rab43-202ENSMUST00000032135 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,37■■■■■ 4,21
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cep170Q6A065 1588 aa41,36■■■■■ 4,21
Rab43-202ENSMUST00000032135 PtprtQ99M80 1454 aa41,33■■■■■ 4,21
Rab43-202ENSMUST00000032135 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,29■■■■■ 4,2
Rab43-202ENSMUST00000032135 Golga3P55937 1487 aa41,28■■■■■ 4,2
Rab43-202ENSMUST00000032135 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa41,26■■■■■ 4,2
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,24■■■■■ 4,19
Rab43-202ENSMUST00000032135 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,14■■■■■ 4,18
Rab43-202ENSMUST00000032135 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,12■■■■■ 4,17
Rab43-202ENSMUST00000032135 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,08■■■■■ 4,17
Rab43-202ENSMUST00000032135 Fgd6Q69ZL1 1399 aa41,07■■■■■ 4,16
Rab43-202ENSMUST00000032135 Grin2bQ01097 1482 aa41,01■■■■■ 4,16
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,97■■■■■ 4,15
Rab43-202ENSMUST00000032135 Pprc1Q6NZN1 1644 aa40,97■■■■■ 4,15
Rab43-202ENSMUST00000032135 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,93■■■■■ 4,14
Rab43-202ENSMUST00000032135 AknaQ80VW7 1404 aa40,86■■■■■ 4,13
Rab43-202ENSMUST00000032135 Fmn1Q05860 1466 aa40,83■■■■■ 4,13
Rab43-202ENSMUST00000032135 Grin2aP35436 1464 aa40,83■■■■■ 4,13
Rab43-202ENSMUST00000032135 Abcc1O35379 1528 aa40,83■■■■■ 4,13
Rab43-202ENSMUST00000032135 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP40,82■■■■■ 4,12
Rab43-202ENSMUST00000032135 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,81■■■■■ 4,12
Rab43-202ENSMUST00000032135 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa40,77■■■■■ 4,12
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