RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NischQ80TM9 1593 aa53,98■■■■■ 6,23
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Abcc8B2RUS7 1588 aa51,71■■■■■ 5,87
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ScribQ80U72 1612 aa48,95■■■■■ 5,43
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rhox8Q6VSS7 320 aa48,32■■■■■ 5,33
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,02■■■■■ 5,28
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kdm5dQ62240 1548 aa47,72■■■■■ 5,23
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NacadQ5SWP3 1504 aa47,59■■■■■ 5,21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47,2■■■■■ 5,15
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,74■■■■■ 5,07
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Baz1aO88379 1555 aa46,62■■■■■ 5,05
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sycp2Q9CUU3 1500 aa46,59■■■■■ 5,05
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rtl1Q7M732 1744 aa46,46■■■■■ 5,03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,12■■■■■ 4,97
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 BicraF8VPZ9 1578 aa45,71■■■■■ 4,91
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,42■■■■■ 4,86
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44,97■■■■■ 4,79
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44,68■■■■■ 4,74
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trim41Q5NCC3 630 aa44,27■■■■■ 4,68
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP44,26■■■■■ 4,68
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44,23■■■■■ 4,67
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP44,06■■■■■ 4,64
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Synj1Q8CHC4 1574 aa44,03■■■■■ 4,64
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP43,98■■■■■ 4,63
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,82■■■■■ 4,61
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Golga3P55937 1487 aa43,28■■■■■ 4,52
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ercc6F8VPZ5 1481 aa43,21■■■■■ 4,51
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43,1■■■■■ 4,49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Top2bQ64511 1612 aa43,02■■■■■ 4,48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Unc13aQ4KUS2 1712 aa42,66■■■■■ 4,42
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP42,62■■■■■ 4,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42,62■■■■■ 4,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa42,58■■■■■ 4,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cep164Q5DU05 1446 aa42,53■■■■■ 4,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Chic1Q8CBW7 227 aa42,51■■■■■ 4,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP42,49■■■■■ 4,39
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fmn1Q05860 1466 aa42,44■■■■■ 4,38
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,44■■■■■ 4,38
Tspan3-201ENSMUST00000034876 TnnQ80Z71 1560 aa42,26■■■■■ 4,35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,26■■■■■ 4,35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa42,2■■■■■ 4,35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kif15Q6P9L6 1387 aa42,15■■■■■ 4,34
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ubl4bQ9CQ84 188 aa42,11■■■■■ 4,33
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,97■■■■■ 4,31
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,83■■■■■ 4,29
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gab3Q8BSM5 595 aa41,81■■■■■ 4,28
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cux2P70298 1426 aa41,75■■■■■ 4,27
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,7■■■■■ 4,27
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,62■■■■■ 4,25
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Il27Q8K3I6 234 aa41,59■■■■■ 4,25
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mrc2Q64449 1479 aa41,48■■■■■ 4,23
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP41,44■■■■■ 4,22
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa41,39■■■■■ 4,22
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Grin2bQ01097 1482 aa41,28■■■■■ 4,2
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NrkQ9R0G8 1455 aa41,21■■■■■ 4,19
Tspan3-201ENSMUST00000034876 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41,18■■■■■ 4,18
Tspan3-201ENSMUST00000034876 PtprkP35822 1457 aa41,15■■■■■ 4,18
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Npm2Q80W85 207 aa41,13■■■■■ 4,17
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Shroom4Q1W617 1475 aa41,12■■■■■ 4,17
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kif21aQ9QXL2 1672 aa41,09■■■■■ 4,17
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cep162Q6ZQ06 1403 aa41,06■■■■■ 4,16
Tspan3-201ENSMUST00000034876 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,06■■■■■ 4,16
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP40,99■■■■■ 4,15
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP40,94■■■■■ 4,14
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Duox2A2AQ99 1517 aa40,93■■■■■ 4,14
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Efcab5A0JP43 1406 aa40,9■■■■■ 4,14
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Arhgap35Q91YM2 1499 aa40,81■■■■■ 4,12
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Crocc2F6XLV1 1638 aa40,8■■■■■ 4,12
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Myt1lP97500 1187 aa40,73■■■■■ 4,11
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Map3k1P53349 1493 aa40,64■■■■■ 4,1
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Samd9lQ69Z37 1561 aa40,64■■■■■ 4,1
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa40,64■■■■■ 4,1
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zeb1Q64318 1117 aa40,62■■■■■ 4,09
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP40,61■■■■■ 4,09
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plb1Q3TTY0 1478 aa40,55■■■■■ 4,08
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP40,5■■■■■ 4,07
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,5■■■■■ 4,07
Tspan3-201ENSMUST00000034876 SynmQ70IV5 1561 aa40,42■■■■■ 4,06
Tspan3-201ENSMUST00000034876 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,4■■■■■ 4,06
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Clip1Q922J3 1391 aa40,39■■■■■ 4,06
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,37■■■■■ 4,05
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Carmil1Q6EDY6 1374 aa40,27■■■■■ 4,04
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ift140E9PY46 1464 aa40,23■■■■■ 4,03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Disp1Q3TDN0 1521 aa40,23■■■■■ 4,03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,17■■■■■ 4,02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pla2r1Q62028 1487 aa40,11■■■■■ 4,01
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Grin2aP35436 1464 aa40,1■■■■■ 4,01
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Eea1Q8BL66 1411 aa40,08■■■■■ 4,01
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP40,06■■■■■ 4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40,04■■■■■ 4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ankrd26Q811D2 1581 aa40,02■■■■■ 4
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