RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000204696.2

Smarcad1-211, Transcript of SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Smarcad1, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55,23■■■■■ 6,43
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 NischQ80TM9 1593 aa54,32■■■■■ 6,29
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,59■■■■■ 6,01
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Abcc9P70170 1546 aa52,57■■■■■ 6,01
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 ScribQ80U72 1612 aa50,91■■■■■ 5,74
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 NacadQ5SWP3 1504 aa49,25■■■■■ 5,48
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Kdm5dQ62240 1548 aa49,16■■■■■ 5,46
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,34■■■■■ 5,33
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,3■■■■■ 5,32
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 BicraF8VPZ9 1578 aa47,66■■■■■ 5,22
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47,35■■■■■ 5,17
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,67■■■■■ 5,06
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Baz1aO88379 1555 aa46,66■■■■■ 5,06
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46,63■■■■■ 5,06
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,56■■■■■ 5,04
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,5■■■■■ 5,03
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,42■■■■■ 5,02
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46,17■■■■■ 4,98
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46■■■■■ 4,95
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45,91■■■■■ 4,94
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,47■■■■■ 4,87
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,45■■■■■ 4,87
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,38■■■■■ 4,86
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,38■■■■■ 4,86
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,24■■■■■ 4,83
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45,17■■■■■ 4,82
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,07■■■■■ 4,81
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44,91■■■■■ 4,78
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44,8■■■■■ 4,76
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,63■■■■■ 4,73
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,6■■■■■ 4,73
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Rtl1Q7M732 1744 aa44,39■■■■■ 4,7
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,24■■■■■ 4,67
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,16■■■■■ 4,66
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44,16■■■■■ 4,66
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 CftrP26361 1476 aa44,13■■■■■ 4,65
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Synj1Q8CHC4 1574 aa44,01■■■■■ 4,64
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Mrc2Q64449 1479 aa44■■■■■ 4,63
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,96■■■■■ 4,63
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,6■■■■■ 4,57
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43,29■■■■■ 4,52
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,19■■■■■ 4,5
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cux2P70298 1426 aa43,14■■■■■ 4,5
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,11■■■■■ 4,49
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,08■■■■■ 4,49
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Trim41Q5NCC3 630 aa42,97■■■■■ 4,47
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,93■■■■■ 4,46
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42,92■■■■■ 4,46
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,63■■■■■ 4,41
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Dnajc5P60904 198 aa42,54■■■■■ 4,4
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cep164Q5DU05 1446 aa42,54■■■■■ 4,4
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,48■■■■■ 4,39
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 TnnQ80Z71 1560 aa42,39■■■■■ 4,38
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Top2bQ64511 1612 aa42,32■■■■■ 4,37
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ccdc18Q640L5 1455 aa42,31■■■■■ 4,36
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Golga3P55937 1487 aa42,29■■■■■ 4,36
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,22■■■■■ 4,35
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,2■■■■■ 4,35
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Camsap1A2AHC3 1581 aa42,15■■■■■ 4,34
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,11■■■■■ 4,33
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Il27Q8K3I6 234 aa42,11■■■■■ 4,33
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42,1■■■■■ 4,33
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Shroom2A2ALU4 1481 aa42,09■■■■■ 4,33
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,07■■■■■ 4,33
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cngb1E1AZ71 1325 aa42,06■■■■■ 4,32
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Fmn1Q05860 1466 aa41,91■■■■■ 4,3
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,84■■■■■ 4,29
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ift140E9PY46 1464 aa41,79■■■■■ 4,28
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Rusc2Q80U22 1514 aa41,73■■■■■ 4,27
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Duox2A2AQ99 1517 aa41,63■■■■■ 4,25
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41,53■■■■■ 4,24
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Grin2bQ01097 1482 aa41,53■■■■■ 4,24
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Col17a1Q07563 1470 aa41,5■■■■■ 4,23
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,39■■■■■ 4,22
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,34■■■■■ 4,21
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,34■■■■■ 4,21
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41,26■■■■■ 4,2
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,26■■■■■ 4,19
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Efcab5A0JP43 1406 aa41,25■■■■■ 4,19
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,23■■■■■ 4,19
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,22■■■■■ 4,19
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41,13■■■■■ 4,17
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,04■■■■■ 4,16
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,03■■■■■ 4,16
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41■■■■■ 4,15
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 NrkQ9R0G8 1455 aa40,99■■■■■ 4,15
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Grin2aP35436 1464 aa40,97■■■■■ 4,15
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,94■■■■■ 4,14
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,94■■■■■ 4,14
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,8■■■■■ 4,12
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Shroom4Q1W617 1475 aa40,79■■■■■ 4,12
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Gpatch8A2A6A1 1505 aa40,77■■■■■ 4,12
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 SynmQ70IV5 1561 aa40,69■■■■■ 4,11
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 PtprkP35822 1457 aa40,69■■■■■ 4,1
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Pla2r1Q62028 1487 aa40,68■■■■■ 4,1
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Adgrl3Q80TS3 1537 aa40,63■■■■■ 4,1
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Chic1Q8CBW7 227 aa40,63■■■■■ 4,09
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Cep170Q6A065 1588 aa40,61■■■■■ 4,09
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40,58■■■■■ 4,09
Smarcad1-211ENSMUST00000204696 AknaQ80VW7 1404 aa40,51■■■■■ 4,08
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