RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174738.1

Gm20402-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm20402, Length 687 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55,34■■■■■ 6,45
Gm20402-201ENSMUST00000174738 NischQ80TM9 1593 aa54,61■■■■■ 6,33
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,89■■■■■ 6,06
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Abcc9P70170 1546 aa52,78■■■■■ 6,04
Gm20402-201ENSMUST00000174738 ScribQ80U72 1612 aa51,17■■■■■ 5,78
Gm20402-201ENSMUST00000174738 NacadQ5SWP3 1504 aa49,52■■■■■ 5,52
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Kdm5dQ62240 1548 aa49,43■■■■■ 5,5
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,58■■■■■ 5,37
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,48■■■■■ 5,35
Gm20402-201ENSMUST00000174738 BicraF8VPZ9 1578 aa47,97■■■■■ 5,27
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47,55■■■■■ 5,2
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa47,3■■■■■ 5,16
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Rhox8Q6VSS7 320 aa47,05■■■■■ 5,12
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Baz1aO88379 1555 aa46,84■■■■■ 5,09
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,68■■■■■ 5,06
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,68■■■■■ 5,06
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,62■■■■■ 5,05
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46,35■■■■■ 5,01
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46,31■■■■■ 5
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46,18■■■■■ 4,98
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,67■■■■■ 4,9
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,66■■■■■ 4,9
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,65■■■■■ 4,9
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,62■■■■■ 4,89
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45,56■■■■■ 4,88
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,46■■■■■ 4,87
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,25■■■■■ 4,83
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45,11■■■■■ 4,81
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45,11■■■■■ 4,81
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,93■■■■■ 4,78
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,63■■■■■ 4,74
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,59■■■■■ 4,73
Gm20402-201ENSMUST00000174738 CftrP26361 1476 aa44,4■■■■■ 4,7
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,38■■■■■ 4,7
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Rtl1Q7M732 1744 aa44,31■■■■■ 4,68
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Synj1Q8CHC4 1574 aa44,28■■■■■ 4,68
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44,27■■■■■ 4,68
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Mrc2Q64449 1479 aa44,22■■■■■ 4,67
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44,17■■■■■ 4,66
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44,14■■■■■ 4,66
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43,7■■■■■ 4,59
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cux2P70298 1426 aa43,47■■■■■ 4,55
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,45■■■■■ 4,55
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,44■■■■■ 4,54
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Trim41Q5NCC3 630 aa43,33■■■■■ 4,53
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,27■■■■■ 4,52
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Lamc3Q9R0B6 1581 aa43,13■■■■■ 4,5
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43,13■■■■■ 4,49
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP43,03■■■■■ 4,48
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Dnajc5P60904 198 aa43■■■■■ 4,47
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cep164Q5DU05 1446 aa42,79■■■■■ 4,44
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Il27Q8K3I6 234 aa42,62■■■■■ 4,41
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,61■■■■■ 4,41
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Golga3P55937 1487 aa42,55■■■■■ 4,4
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,54■■■■■ 4,4
Gm20402-201ENSMUST00000174738 TnnQ80Z71 1560 aa42,53■■■■■ 4,4
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,51■■■■■ 4,4
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ccdc18Q640L5 1455 aa42,5■■■■■ 4,39
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cngb1E1AZ71 1325 aa42,49■■■■■ 4,39
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Top2bQ64511 1612 aa42,47■■■■■ 4,39
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,46■■■■■ 4,39
Gm20402-201ENSMUST00000174738 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42,39■■■■■ 4,38
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Camsap1A2AHC3 1581 aa42,33■■■■■ 4,37
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Shroom2A2ALU4 1481 aa42,29■■■■■ 4,36
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,24■■■■■ 4,35
Gm20402-201ENSMUST00000174738 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP42,11■■■■■ 4,33
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Fmn1Q05860 1466 aa42,09■■■■■ 4,33
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ift140E9PY46 1464 aa41,99■■■■■ 4,31
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41,93■■■■■ 4,3
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Duox2A2AQ99 1517 aa41,91■■■■■ 4,3
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Rusc2Q80U22 1514 aa41,88■■■■■ 4,29
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Col17a1Q07563 1470 aa41,82■■■■■ 4,29
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Grin2bQ01097 1482 aa41,76■■■■■ 4,28
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,72■■■■■ 4,27
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41,7■■■■■ 4,27
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,54■■■■■ 4,24
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Efcab5A0JP43 1406 aa41,5■■■■■ 4,23
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,49■■■■■ 4,23
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,44■■■■■ 4,22
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,4■■■■■ 4,22
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,38■■■■■ 4,21
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,36■■■■■ 4,21
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41,36■■■■■ 4,21
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41,23■■■■■ 4,19
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,21■■■■■ 4,19
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Grin2aP35436 1464 aa41,21■■■■■ 4,19
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Magi3Q9EQJ9 1476 aa41,2■■■■■ 4,19
Gm20402-201ENSMUST00000174738 NrkQ9R0G8 1455 aa41,2■■■■■ 4,19
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Chic1Q8CBW7 227 aa41,14■■■■■ 4,18
Gm20402-201ENSMUST00000174738 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41,14■■■■■ 4,18
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Fgd6Q69ZL1 1399 aa41,08■■■■■ 4,17
Gm20402-201ENSMUST00000174738 PtprkP35822 1457 aa41,07■■■■■ 4,16
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Shroom4Q1W617 1475 aa41,01■■■■■ 4,16
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Pla2r1Q62028 1487 aa40,93■■■■■ 4,14
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Adgrl3Q80TS3 1537 aa40,89■■■■■ 4,14
Gm20402-201ENSMUST00000174738 SynmQ70IV5 1561 aa40,86■■■■■ 4,13
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40,84■■■■■ 4,13
Gm20402-201ENSMUST00000174738 AknaQ80VW7 1404 aa40,82■■■■■ 4,12
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Cep170Q6A065 1588 aa40,81■■■■■ 4,12
Gm20402-201ENSMUST00000174738 Gm156Q58A37 223 aa40,8■■■■■ 4,12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,2 ms