RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000110235.1

Gfra4-204, Transcript of GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gfra4, Length 573 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55,21■■■■■ 6,43
Gfra4-204ENSMUST00000110235 NischQ80TM9 1593 aa54,39■■■■■ 6,3
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,76■■■■■ 6,04
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Abcc9P70170 1546 aa52,51■■■■■ 6
Gfra4-204ENSMUST00000110235 ScribQ80U72 1612 aa51,19■■■■■ 5,78
Gfra4-204ENSMUST00000110235 NacadQ5SWP3 1504 aa49,55■■■■■ 5,52
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Kdm5dQ62240 1548 aa49,39■■■■■ 5,5
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,61■■■■■ 5,37
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,3■■■■■ 5,32
Gfra4-204ENSMUST00000110235 BicraF8VPZ9 1578 aa48,03■■■■■ 5,28
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa47,81■■■■■ 5,24
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47,33■■■■■ 5,17
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,85■■■■■ 5,09
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,62■■■■■ 5,05
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Baz1aO88379 1555 aa46,6■■■■■ 5,05
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46,6■■■■■ 5,05
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,5■■■■■ 5,03
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,33■■■■■ 5,01
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46,26■■■■■ 5
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46,16■■■■■ 4,98
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,89■■■■■ 4,94
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,83■■■■■ 4,93
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,67■■■■■ 4,9
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,61■■■■■ 4,89
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,46■■■■■ 4,87
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,42■■■■■ 4,86
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45,41■■■■■ 4,86
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45,16■■■■■ 4,82
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45,16■■■■■ 4,82
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP45,07■■■■■ 4,81
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,81■■■■■ 4,76
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,8■■■■■ 4,76
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Mrc2Q64449 1479 aa44,43■■■■■ 4,7
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,38■■■■■ 4,69
Gfra4-204ENSMUST00000110235 CftrP26361 1476 aa44,21■■■■■ 4,67
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44,09■■■■■ 4,65
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Synj1Q8CHC4 1574 aa44,05■■■■■ 4,64
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,92■■■■■ 4,62
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Dnajc5P60904 198 aa43,82■■■■■ 4,61
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Trim41Q5NCC3 630 aa43,82■■■■■ 4,61
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,78■■■■■ 4,6
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Rtl1Q7M732 1744 aa43,78■■■■■ 4,6
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43,57■■■■■ 4,57
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cux2P70298 1426 aa43,51■■■■■ 4,56
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,46■■■■■ 4,55
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,41■■■■■ 4,54
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,4■■■■■ 4,54
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43,21■■■■■ 4,51
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP43,09■■■■■ 4,49
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Lamc3Q9R0B6 1581 aa43,01■■■■■ 4,48
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,82■■■■■ 4,44
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cep164Q5DU05 1446 aa42,8■■■■■ 4,44
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Shroom2A2ALU4 1481 aa42,67■■■■■ 4,42
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,58■■■■■ 4,41
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Il27Q8K3I6 234 aa42,57■■■■■ 4,41
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,54■■■■■ 4,4
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,52■■■■■ 4,4
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ccdc18Q640L5 1455 aa42,44■■■■■ 4,38
Gfra4-204ENSMUST00000110235 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42,36■■■■■ 4,37
Gfra4-204ENSMUST00000110235 TnnQ80Z71 1560 aa42,31■■■■■ 4,36
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42,29■■■■■ 4,36
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Col17a1Q07563 1470 aa42,25■■■■■ 4,35
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,24■■■■■ 4,35
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Camsap1A2AHC3 1581 aa42,18■■■■■ 4,34
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Golga3P55937 1487 aa42,17■■■■■ 4,34
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cngb1E1AZ71 1325 aa42,17■■■■■ 4,34
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Top2bQ64511 1612 aa42,12■■■■■ 4,33
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ift140E9PY46 1464 aa42,05■■■■■ 4,32
Gfra4-204ENSMUST00000110235 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP42,03■■■■■ 4,32
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP42,01■■■■■ 4,32
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Rusc2Q80U22 1514 aa41,99■■■■■ 4,31
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Duox2A2AQ99 1517 aa41,83■■■■■ 4,29
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Fmn1Q05860 1466 aa41,79■■■■■ 4,28
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,7■■■■■ 4,27
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Grin2bQ01097 1482 aa41,6■■■■■ 4,25
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41,58■■■■■ 4,25
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,49■■■■■ 4,23
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,48■■■■■ 4,23
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,43■■■■■ 4,22
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Efcab5A0JP43 1406 aa41,37■■■■■ 4,21
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,36■■■■■ 4,21
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,31■■■■■ 4,2
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41,28■■■■■ 4,2
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Adgrl3Q80TS3 1537 aa41,18■■■■■ 4,18
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Fgd6Q69ZL1 1399 aa41,18■■■■■ 4,18
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Grin2aP35436 1464 aa41,15■■■■■ 4,18
Gfra4-204ENSMUST00000110235 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41,15■■■■■ 4,18
Gfra4-204ENSMUST00000110235 PtprkP35822 1457 aa41,13■■■■■ 4,17
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Magi3Q9EQJ9 1476 aa41,11■■■■■ 4,17
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa41,1■■■■■ 4,17
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa41,07■■■■■ 4,17
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Gm156Q58A37 223 aa41,05■■■■■ 4,16
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa41,03■■■■■ 4,16
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa41,03■■■■■ 4,16
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Cep170Q6A065 1588 aa41,02■■■■■ 4,16
Gfra4-204ENSMUST00000110235 NrkQ9R0G8 1455 aa40,96■■■■■ 4,15
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40,95■■■■■ 4,15
Gfra4-204ENSMUST00000110235 AknaQ80VW7 1404 aa40,91■■■■■ 4,14
Gfra4-204ENSMUST00000110235 PtprtQ99M80 1454 aa40,84■■■■■ 4,13
Gfra4-204ENSMUST00000110235 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40,84■■■■■ 4,13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,6 ms