RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000162246.8

Hmgn3-202, Transcript of High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hmgn3, Length 983 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54,7■■■■■ 6,35
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 NischQ80TM9 1593 aa53,81■■■■■ 6,2
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,21■■■■■ 5,95
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Abcc9P70170 1546 aa51,94■■■■■ 5,9
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 ScribQ80U72 1612 aa50,73■■■■■ 5,71
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 NacadQ5SWP3 1504 aa49,12■■■■■ 5,45
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Kdm5dQ62240 1548 aa48,93■■■■■ 5,42
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,17■■■■■ 5,3
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47,81■■■■■ 5,24
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 BicraF8VPZ9 1578 aa47,59■■■■■ 5,21
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa47,49■■■■■ 5,19
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,83■■■■■ 5,09
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,51■■■■■ 5,04
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46,3■■■■■ 5
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Baz1aO88379 1555 aa46,1■■■■■ 4,97
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,03■■■■■ 4,96
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rhox8Q6VSS7 320 aa45,98■■■■■ 4,95
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45,9■■■■■ 4,94
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45,86■■■■■ 4,93
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45,67■■■■■ 4,9
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,58■■■■■ 4,89
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,53■■■■■ 4,88
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,28■■■■■ 4,84
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,2■■■■■ 4,83
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,12■■■■■ 4,81
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,07■■■■■ 4,81
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44,88■■■■■ 4,78
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44,78■■■■■ 4,76
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44,75■■■■■ 4,75
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,74■■■■■ 4,75
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,59■■■■■ 4,73
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,44■■■■■ 4,7
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Mrc2Q64449 1479 aa44,13■■■■■ 4,65
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43,99■■■■■ 4,63
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 CftrP26361 1476 aa43,73■■■■■ 4,59
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dnajc5P60904 198 aa43,73■■■■■ 4,59
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,66■■■■■ 4,58
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Trim41Q5NCC3 630 aa43,62■■■■■ 4,57
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Synj1Q8CHC4 1574 aa43,54■■■■■ 4,56
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,46■■■■■ 4,55
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rtl1Q7M732 1744 aa43,26■■■■■ 4,52
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43,17■■■■■ 4,5
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,16■■■■■ 4,5
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cux2P70298 1426 aa43,13■■■■■ 4,49
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43,1■■■■■ 4,49
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,03■■■■■ 4,48
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,01■■■■■ 4,48
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42,86■■■■■ 4,45
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,71■■■■■ 4,43
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,58■■■■■ 4,41
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,55■■■■■ 4,4
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Shroom2A2ALU4 1481 aa42,48■■■■■ 4,39
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cep164Q5DU05 1446 aa42,44■■■■■ 4,38
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,22■■■■■ 4,35
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,16■■■■■ 4,34
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,14■■■■■ 4,34
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Il27Q8K3I6 234 aa42,12■■■■■ 4,33
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ccdc18Q640L5 1455 aa42,07■■■■■ 4,33
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42,05■■■■■ 4,32
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Col17a1Q07563 1470 aa42,04■■■■■ 4,32
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41,96■■■■■ 4,31
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Crocc2F6XLV1 1638 aa41,88■■■■■ 4,3
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Top2bQ64511 1612 aa41,88■■■■■ 4,3
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 TnnQ80Z71 1560 aa41,84■■■■■ 4,29
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41,76■■■■■ 4,28
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,75■■■■■ 4,27
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ift140E9PY46 1464 aa41,72■■■■■ 4,27
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rusc2Q80U22 1514 aa41,68■■■■■ 4,26
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Golga3P55937 1487 aa41,64■■■■■ 4,26
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,63■■■■■ 4,25
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,61■■■■■ 4,25
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41,41■■■■■ 4,22
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Duox2A2AQ99 1517 aa41,41■■■■■ 4,22
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Fmn1Q05860 1466 aa41,31■■■■■ 4,2
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,29■■■■■ 4,2
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Grin2bQ01097 1482 aa41,15■■■■■ 4,18
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,14■■■■■ 4,18
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,11■■■■■ 4,17
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,04■■■■■ 4,16
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,02■■■■■ 4,16
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40,95■■■■■ 4,15
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Efcab5A0JP43 1406 aa40,94■■■■■ 4,14
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Adgrl3Q80TS3 1537 aa40,94■■■■■ 4,14
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa40,88■■■■■ 4,13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 PtprkP35822 1457 aa40,87■■■■■ 4,13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa40,86■■■■■ 4,13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,86■■■■■ 4,13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,83■■■■■ 4,13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa40,83■■■■■ 4,13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,79■■■■■ 4,12
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Grin2aP35436 1464 aa40,77■■■■■ 4,12
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cep170Q6A065 1588 aa40,75■■■■■ 4,11
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Gm156Q58A37 223 aa40,75■■■■■ 4,11
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40,75■■■■■ 4,11
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,69■■■■■ 4,1
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 PtprtQ99M80 1454 aa40,59■■■■■ 4,09
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 AknaQ80VW7 1404 aa40,58■■■■■ 4,09
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 NrkQ9R0G8 1455 aa40,5■■■■■ 4,07
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Abcc1O35379 1528 aa40,47■■■■■ 4,07
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP40,39■■■■■ 4,06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28,3 ms