Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Atf4Q06507 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atf4Q06507 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atf4Q06507 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Atf4Q06507 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Atf4Q06507 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atf4Q06507 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atf4Q06507 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Atf4Q06507 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atf4Q06507 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atf4Q06507 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Atf4Q06507 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atf4Q06507 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf4Q06507 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf4Q06507 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf4Q06507 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf4Q06507 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf4Q06507 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf4Q06507 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf4Q06507 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atf4Q06507 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atf4Q06507 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf4Q06507 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf4Q06507 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf4Q06507 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Atf4Q06507 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf4Q06507 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf4Q06507 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf4Q06507 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf4Q06507 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf4Q06507 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf4Q06507 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf4Q06507 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atf4Q06507 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf4Q06507 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Atf4Q06507 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf4Q06507 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf4Q06507 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf4Q06507 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf4Q06507 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf4Q06507 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf4Q06507 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf4Q06507 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf4Q06507 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf4Q06507 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf4Q06507 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf4Q06507 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf4Q06507 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf4Q06507 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf4Q06507 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf4Q06507 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf4Q06507 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf4Q06507 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf4Q06507 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf4Q06507 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf4Q06507 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf4Q06507 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf4Q06507 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf4Q06507 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf4Q06507 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf4Q06507 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf4Q06507 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf4Q06507 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf4Q06507 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf4Q06507 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf4Q06507 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf4Q06507 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf4Q06507 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf4Q06507 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf4Q06507 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf4Q06507 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf4Q06507 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf4Q06507 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf4Q06507 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf4Q06507 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf4Q06507 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf4Q06507 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf4Q06507 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf4Q06507 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf4Q06507 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf4Q06507 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf4Q06507 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf4Q06507 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf4Q06507 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf4Q06507 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf4Q06507 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf4Q06507 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf4Q06507 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf4Q06507 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf4Q06507 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf4Q06507 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf4Q06507 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf4Q06507 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf4Q06507 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf4Q06507 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf4Q06507 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf4Q06507 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf4Q06507 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf4Q06507 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf4Q06507 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms