RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105357.1

Reep6-204, Transcript of Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Reep6, Length 2,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Rhox8Q6VSS7 320 aa48,44■■■■■ 5,35
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43,34■■■■■ 4,53
Reep6-204ENSMUST00000105357 Top2bQ64511 1612 aa43,16■■■■■ 4,5
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Kif15Q6P9L6 1387 aa42,82■■■■■ 4,44
Reep6-204ENSMUST00000105357 Baz1bQ9Z277 1479 aa42,8■■■■■ 4,44
Reep6-204ENSMUST00000105357 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,76■■■■■ 4,44
Reep6-204ENSMUST00000105357 HrcG5E8J6 738 aa42,75■■■■■ 4,43
Reep6-204ENSMUST00000105357 Fmn1Q05860 1466 aa42,66■■■■■ 4,42
Reep6-204ENSMUST00000105357 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa42,61■■■■■ 4,41
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Chic1Q8CBW7 227 aa42,53■■■■■ 4,4
Reep6-204ENSMUST00000105357 Cux2P70298 1426 aa42,53■■■■■ 4,4
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Cep164Q5DU05 1446 aa42,17■■■■■ 4,34
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Kif21aQ9QXL2 1672 aa41,88■■■■■ 4,29
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Grin2bQ01097 1482 aa41,71■■■■■ 4,27
Reep6-204ENSMUST00000105357 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP41,71■■■■■ 4,27
Reep6-204ENSMUST00000105357 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,63■■■■■ 4,26
Reep6-204ENSMUST00000105357 NrkQ9R0G8 1455 aa41,51■■■■■ 4,24
Reep6-204ENSMUST00000105357 Duox2A2AQ99 1517 aa41,5■■■■■ 4,23
Reep6-204ENSMUST00000105357 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa41,47■■■■■ 4,23
Reep6-204ENSMUST00000105357 Crocc2F6XLV1 1638 aa41,46■■■■■ 4,23
Reep6-204ENSMUST00000105357 PtprkP35822 1457 aa41,44■■■■■ 4,23
Reep6-204ENSMUST00000105357 Shroom4Q1W617 1475 aa41,39■■■■■ 4,22
Reep6-204ENSMUST00000105357 Efcab5A0JP43 1406 aa41,38■■■■■ 4,21
Reep6-204ENSMUST00000105357 Plb1Q3TTY0 1478 aa41,35■■■■■ 4,21
Reep6-204ENSMUST00000105357 Npm2Q80W85 207 aa41,35■■■■■ 4,21
Reep6-204ENSMUST00000105357 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP41,31■■■■■ 4,2
Reep6-204ENSMUST00000105357 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa41,29■■■■■ 4,2
Reep6-204ENSMUST00000105357 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,16■■■■■ 4,18
Reep6-204ENSMUST00000105357 Zeb1Q64318 1117 aa41,05■■■■■ 4,16
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Ift140E9PY46 1464 aa40,97■■■■■ 4,15
Reep6-204ENSMUST00000105357 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,95■■■■■ 4,15
Reep6-204ENSMUST00000105357 Arhgap35Q91YM2 1499 aa40,92■■■■■ 4,14
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa40,91■■■■■ 4,14
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Reep6-204ENSMUST00000105357 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40,63■■■■■ 4,09
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Reep6-204ENSMUST00000105357 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,54■■■■■ 4,08
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