RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000217317.1

Rpsa-204, Transcript of 40S ribosomal protein SA, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rpsa, Length 1,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55,29■■■■■ 6,44
Rpsa-204ENSMUST00000217317 NischQ80TM9 1593 aa54,58■■■■■ 6,33
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,75■■■■■ 6,04
Rpsa-204ENSMUST00000217317 ScribQ80U72 1612 aa50,82■■■■■ 5,73
Rpsa-204ENSMUST00000217317 NacadQ5SWP3 1504 aa49,19■■■■■ 5,47
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Kdm5dQ62240 1548 aa49,15■■■■■ 5,46
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,58■■■■■ 5,37
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,24■■■■■ 5,31
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47,58■■■■■ 5,21
Rpsa-204ENSMUST00000217317 BicraF8VPZ9 1578 aa47,57■■■■■ 5,21
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Rhox8Q6VSS7 320 aa47,2■■■■■ 5,15
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,94■■■■■ 5,1
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Baz1aO88379 1555 aa46,93■■■■■ 5,1
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,73■■■■■ 5,07
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,16■■■■■ 4,98
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46,02■■■■■ 4,96
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45,77■■■■■ 4,92
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP45,77■■■■■ 4,92
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,58■■■■■ 4,89
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45,45■■■■■ 4,87
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45,38■■■■■ 4,86
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,19■■■■■ 4,82
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,18■■■■■ 4,82
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,01■■■■■ 4,8
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Rtl1Q7M732 1744 aa44,94■■■■■ 4,78
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44,79■■■■■ 4,76
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Fam135aQ6NS59 1506 aa44,76■■■■■ 4,76
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44,72■■■■■ 4,75
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,42■■■■■ 4,7
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44,32■■■■■ 4,68
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Synj1Q8CHC4 1574 aa44,3■■■■■ 4,68
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44,27■■■■■ 4,68
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,22■■■■■ 4,67
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44,18■■■■■ 4,66
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,14■■■■■ 4,66
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ubl4bQ9CQ84 188 aa43,97■■■■■ 4,63
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Mrc2Q64449 1479 aa43,69■■■■■ 4,58
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Trim41Q5NCC3 630 aa43,5■■■■■ 4,55
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43,5■■■■■ 4,55
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43,23■■■■■ 4,51
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,14■■■■■ 4,5
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Cux2P70298 1426 aa43,1■■■■■ 4,49
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Lamc3Q9R0B6 1581 aa43,05■■■■■ 4,48
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Golga3P55937 1487 aa42,77■■■■■ 4,44
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42,75■■■■■ 4,43
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Top2bQ64511 1612 aa42,75■■■■■ 4,43
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa42,73■■■■■ 4,43
Rpsa-204ENSMUST00000217317 TnnQ80Z71 1560 aa42,63■■■■■ 4,41
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,6■■■■■ 4,41
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Cep164Q5DU05 1446 aa42,5■■■■■ 4,39
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ccdc18Q640L5 1455 aa42,38■■■■■ 4,37
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Camsap1A2AHC3 1581 aa42,29■■■■■ 4,36
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Fmn1Q05860 1466 aa42,27■■■■■ 4,36
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,2■■■■■ 4,35
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,1■■■■■ 4,33
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,03■■■■■ 4,32
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Crocc2F6XLV1 1638 aa42■■■■■ 4,31
Rpsa-204ENSMUST00000217317 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,93■■■■■ 4,3
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Duox2A2AQ99 1517 aa41,73■■■■■ 4,27
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Grin2bQ01097 1482 aa41,73■■■■■ 4,27
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ift140E9PY46 1464 aa41,68■■■■■ 4,26
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,67■■■■■ 4,26
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Shroom2A2ALU4 1481 aa41,52■■■■■ 4,24
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Rusc2Q80U22 1514 aa41,51■■■■■ 4,24
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,5■■■■■ 4,23
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Dnajc5P60904 198 aa41,46■■■■■ 4,23
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Efcab5A0JP43 1406 aa41,44■■■■■ 4,22
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Samd9lQ69Z37 1561 aa41,43■■■■■ 4,22
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Disp1Q3TDN0 1521 aa41,42■■■■■ 4,22
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Chic1Q8CBW7 227 aa41,36■■■■■ 4,21
Rpsa-204ENSMUST00000217317 NrkQ9R0G8 1455 aa41,3■■■■■ 4,2
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41,25■■■■■ 4,19
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,22■■■■■ 4,19
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41,12■■■■■ 4,17
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Shroom4Q1W617 1475 aa41,11■■■■■ 4,17
Rpsa-204ENSMUST00000217317 PtprkP35822 1457 aa41,09■■■■■ 4,17
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Rpsa-204ENSMUST00000217317 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,67■■■■■ 4,1
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Zeb1Q64318 1117 aa40,62■■■■■ 4,09
Rpsa-204ENSMUST00000217317 HrcG5E8J6 738 aa40,58■■■■■ 4,09
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP40,57■■■■■ 4,09
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa40,56■■■■■ 4,08
Rpsa-204ENSMUST00000217317 Npm2Q80W85 207 aa40,52■■■■■ 4,08
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