Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRYQ05066 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRYQ05066 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRYQ05066 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRYQ05066 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SRYQ05066 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRYQ05066 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRYQ05066 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRYQ05066 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRYQ05066 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SRYQ05066 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRYQ05066 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRYQ05066 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRYQ05066 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRYQ05066 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRYQ05066 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRYQ05066 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRYQ05066 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRYQ05066 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRYQ05066 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRYQ05066 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRYQ05066 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRYQ05066 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRYQ05066 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRYQ05066 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRYQ05066 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRYQ05066 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRYQ05066 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRYQ05066 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRYQ05066 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRYQ05066 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRYQ05066 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRYQ05066 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRYQ05066 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRYQ05066 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRYQ05066 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRYQ05066 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRYQ05066 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRYQ05066 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRYQ05066 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRYQ05066 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRYQ05066 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRYQ05066 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRYQ05066 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRYQ05066 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRYQ05066 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRYQ05066 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRYQ05066 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRYQ05066 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRYQ05066 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRYQ05066 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRYQ05066 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRYQ05066 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRYQ05066 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRYQ05066 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRYQ05066 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRYQ05066 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRYQ05066 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRYQ05066 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRYQ05066 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRYQ05066 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRYQ05066 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRYQ05066 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRYQ05066 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRYQ05066 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRYQ05066 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRYQ05066 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRYQ05066 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRYQ05066 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRYQ05066 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRYQ05066 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRYQ05066 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRYQ05066 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRYQ05066 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRYQ05066 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRYQ05066 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRYQ05066 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRYQ05066 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRYQ05066 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRYQ05066 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRYQ05066 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRYQ05066 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRYQ05066 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRYQ05066 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRYQ05066 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRYQ05066 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRYQ05066 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRYQ05066 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRYQ05066 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRYQ05066 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRYQ05066 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRYQ05066 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRYQ05066 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRYQ05066 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms