Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL10A1Q03692 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL10A1Q03692 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL10A1Q03692 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL10A1Q03692 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL10A1Q03692 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL10A1Q03692 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms