Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX2Q02962 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX2Q02962 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAX2Q02962 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX2Q02962 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX2Q02962 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms