Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLOD1Q02809 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLOD1Q02809 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PLOD1Q02809 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLOD1Q02809 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLOD1Q02809 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms