Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OC90Q02509 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OC90Q02509 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OC90Q02509 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OC90Q02509 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OC90Q02509 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OC90Q02509 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OC90Q02509 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OC90Q02509 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OC90Q02509 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OC90Q02509 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OC90Q02509 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OC90Q02509 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OC90Q02509 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OC90Q02509 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OC90Q02509 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OC90Q02509 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OC90Q02509 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OC90Q02509 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OC90Q02509 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OC90Q02509 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OC90Q02509 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OC90Q02509 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OC90Q02509 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OC90Q02509 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OC90Q02509 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OC90Q02509 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OC90Q02509 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OC90Q02509 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OC90Q02509 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OC90Q02509 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OC90Q02509 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OC90Q02509 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OC90Q02509 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OC90Q02509 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OC90Q02509 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OC90Q02509 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OC90Q02509 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OC90Q02509 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OC90Q02509 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OC90Q02509 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OC90Q02509 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OC90Q02509 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OC90Q02509 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OC90Q02509 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OC90Q02509 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OC90Q02509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OC90Q02509 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OC90Q02509 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OC90Q02509 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OC90Q02509 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OC90Q02509 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OC90Q02509 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OC90Q02509 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OC90Q02509 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OC90Q02509 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OC90Q02509 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OC90Q02509 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OC90Q02509 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OC90Q02509 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OC90Q02509 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OC90Q02509 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OC90Q02509 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OC90Q02509 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OC90Q02509 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OC90Q02509 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OC90Q02509 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OC90Q02509 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OC90Q02509 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OC90Q02509 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OC90Q02509 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OC90Q02509 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OC90Q02509 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OC90Q02509 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OC90Q02509 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OC90Q02509 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OC90Q02509 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OC90Q02509 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
OC90Q02509 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OC90Q02509 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OC90Q02509 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OC90Q02509 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OC90Q02509 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OC90Q02509 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OC90Q02509 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OC90Q02509 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OC90Q02509 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OC90Q02509 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms