Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MUC3AQ02505 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MUC3AQ02505 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MUC3AQ02505 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC3AQ02505 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MUC3AQ02505 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MUC3AQ02505 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MUC3AQ02505 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms