Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHDQ02161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHDQ02161 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHDQ02161 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHDQ02161 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHDQ02161 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHDQ02161 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHDQ02161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHDQ02161 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHDQ02161 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHDQ02161 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHDQ02161 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHDQ02161 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHDQ02161 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHDQ02161 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHDQ02161 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHDQ02161 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHDQ02161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHDQ02161 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHDQ02161 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHDQ02161 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHDQ02161 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHDQ02161 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHDQ02161 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHDQ02161 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHDQ02161 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RHDQ02161 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHDQ02161 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHDQ02161 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHDQ02161 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHDQ02161 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHDQ02161 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHDQ02161 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHDQ02161 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHDQ02161 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHDQ02161 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHDQ02161 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RHDQ02161 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RHDQ02161 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHDQ02161 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHDQ02161 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHDQ02161 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHDQ02161 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHDQ02161 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHDQ02161 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHDQ02161 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHDQ02161 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHDQ02161 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHDQ02161 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHDQ02161 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHDQ02161 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHDQ02161 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHDQ02161 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHDQ02161 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHDQ02161 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHDQ02161 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHDQ02161 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHDQ02161 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHDQ02161 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHDQ02161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHDQ02161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RHDQ02161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHDQ02161 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHDQ02161 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHDQ02161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHDQ02161 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHDQ02161 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHDQ02161 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHDQ02161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RHDQ02161 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHDQ02161 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHDQ02161 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHDQ02161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHDQ02161 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHDQ02161 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHDQ02161 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHDQ02161 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHDQ02161 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHDQ02161 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHDQ02161 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHDQ02161 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHDQ02161 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHDQ02161 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHDQ02161 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHDQ02161 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHDQ02161 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHDQ02161 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHDQ02161 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHDQ02161 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHDQ02161 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RHDQ02161 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHDQ02161 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHDQ02161 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHDQ02161 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms