Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms