Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD83Q01151 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD83Q01151 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD83Q01151 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD83Q01151 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD83Q01151 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD83Q01151 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD83Q01151 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD83Q01151 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD83Q01151 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD83Q01151 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD83Q01151 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD83Q01151 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD83Q01151 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD83Q01151 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD83Q01151 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD83Q01151 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD83Q01151 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD83Q01151 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD83Q01151 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD83Q01151 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD83Q01151 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD83Q01151 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD83Q01151 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD83Q01151 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD83Q01151 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD83Q01151 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD83Q01151 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD83Q01151 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD83Q01151 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD83Q01151 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD83Q01151 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD83Q01151 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD83Q01151 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD83Q01151 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD83Q01151 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD83Q01151 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD83Q01151 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD83Q01151 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD83Q01151 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD83Q01151 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD83Q01151 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD83Q01151 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD83Q01151 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD83Q01151 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD83Q01151 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD83Q01151 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD83Q01151 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD83Q01151 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD83Q01151 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD83Q01151 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD83Q01151 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD83Q01151 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD83Q01151 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD83Q01151 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD83Q01151 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD83Q01151 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD83Q01151 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD83Q01151 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD83Q01151 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD83Q01151 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD83Q01151 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD83Q01151 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD83Q01151 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD83Q01151 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD83Q01151 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD83Q01151 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD83Q01151 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD83Q01151 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD83Q01151 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD83Q01151 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD83Q01151 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD83Q01151 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD83Q01151 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD83Q01151 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD83Q01151 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD83Q01151 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD83Q01151 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD83Q01151 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD83Q01151 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD83Q01151 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD83Q01151 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD83Q01151 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD83Q01151 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD83Q01151 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD83Q01151 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD83Q01151 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD83Q01151 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD83Q01151 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD83Q01151 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD83Q01151 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD83Q01151 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD83Q01151 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD83Q01151 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms