Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAMQ00059 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFAMQ00059 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFAMQ00059 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TFAMQ00059 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAMQ00059 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAMQ00059 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms