Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FGD1P98174 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FGD1P98174 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FGD1P98174 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FGD1P98174 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FGD1P98174 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FGD1P98174 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FGD1P98174 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FGD1P98174 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FGD1P98174 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FGD1P98174 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FGD1P98174 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FGD1P98174 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FGD1P98174 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FGD1P98174 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FGD1P98174 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FGD1P98174 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FGD1P98174 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
FGD1P98174 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FGD1P98174 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FGD1P98174 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FGD1P98174 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FGD1P98174 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FGD1P98174 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FGD1P98174 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FGD1P98174 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FGD1P98174 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FGD1P98174 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FGD1P98174 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FGD1P98174 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FGD1P98174 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FGD1P98174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FGD1P98174 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGD1P98174 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGD1P98174 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGD1P98174 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGD1P98174 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGD1P98174 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGD1P98174 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FGD1P98174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FGD1P98174 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FGD1P98174 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
FGD1P98174 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
FGD1P98174 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FGD1P98174 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FGD1P98174 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FGD1P98174 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FGD1P98174 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FGD1P98174 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD1P98174 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD1P98174 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD1P98174 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD1P98174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD1P98174 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD1P98174 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FGD1P98174 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FGD1P98174 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FGD1P98174 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FGD1P98174 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FGD1P98174 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FGD1P98174 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FGD1P98174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGD1P98174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGD1P98174 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGD1P98174 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
FGD1P98174 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FGD1P98174 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FGD1P98174 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FGD1P98174 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FGD1P98174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FGD1P98174 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGD1P98174 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGD1P98174 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FGD1P98174 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FGD1P98174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FGD1P98174 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FGD1P98174 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FGD1P98174 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FGD1P98174 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FGD1P98174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FGD1P98174 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FGD1P98174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FGD1P98174 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FGD1P98174 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FGD1P98174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FGD1P98174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FGD1P98174 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FGD1P98174 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FGD1P98174 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
FGD1P98174 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FGD1P98174 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FGD1P98174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FGD1P98174 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FGD1P98174 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms