Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP1AP78559 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP1AP78559 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP1AP78559 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP1AP78559 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP1AP78559 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms