Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RELNP78509 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELNP78509 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELNP78509 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELNP78509 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RELNP78509 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RELNP78509 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RELNP78509 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELNP78509 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELNP78509 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELNP78509 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELNP78509 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELNP78509 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELNP78509 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RELNP78509 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RELNP78509 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RELNP78509 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RELNP78509 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RELNP78509 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELNP78509 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELNP78509 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELNP78509 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELNP78509 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELNP78509 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELNP78509 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELNP78509 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELNP78509 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RELNP78509 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RELNP78509 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RELNP78509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RELNP78509 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RELNP78509 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RELNP78509 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELNP78509 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELNP78509 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELNP78509 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELNP78509 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RELNP78509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RELNP78509 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RELNP78509 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RELNP78509 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RELNP78509 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RELNP78509 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RELNP78509 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RELNP78509 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELNP78509 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELNP78509 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELNP78509 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RELNP78509 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RELNP78509 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELNP78509 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELNP78509 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RELNP78509 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELNP78509 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELNP78509 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELNP78509 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELNP78509 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELNP78509 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELNP78509 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RELNP78509 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELNP78509 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELNP78509 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELNP78509 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELNP78509 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELNP78509 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELNP78509 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELNP78509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELNP78509 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELNP78509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELNP78509 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELNP78509 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELNP78509 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELNP78509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELNP78509 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELNP78509 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RELNP78509 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELNP78509 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELNP78509 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RELNP78509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RELNP78509 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RELNP78509 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELNP78509 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RELNP78509 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELNP78509 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELNP78509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELNP78509 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELNP78509 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RELNP78509 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RELNP78509 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RELNP78509 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms