Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX3P78415 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX3P78415 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX3P78415 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IRX3P78415 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX3P78415 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
IRX3P78415 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
IRX3P78415 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
IRX3P78415 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX3P78415 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX3P78415 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX3P78415 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX3P78415 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX3P78415 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX3P78415 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX3P78415 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX3P78415 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX3P78415 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX3P78415 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX3P78415 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX3P78415 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX3P78415 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX3P78415 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX3P78415 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX3P78415 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX3P78415 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX3P78415 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX3P78415 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
IRX3P78415 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX3P78415 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX3P78415 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX3P78415 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX3P78415 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRX3P78415 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRX3P78415 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IRX3P78415 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRX3P78415 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRX3P78415 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX3P78415 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IRX3P78415 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX3P78415 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX3P78415 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX3P78415 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX3P78415 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
IRX3P78415 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
IRX3P78415 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
IRX3P78415 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX3P78415 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX3P78415 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX3P78415 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX3P78415 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX3P78415 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX3P78415 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX3P78415 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX3P78415 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX3P78415 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX3P78415 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IRX3P78415 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IRX3P78415 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX3P78415 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX3P78415 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX3P78415 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX3P78415 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX3P78415 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX3P78415 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX3P78415 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX3P78415 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX3P78415 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
IRX3P78415 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IRX3P78415 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IRX3P78415 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
IRX3P78415 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IRX3P78415 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IRX3P78415 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX3P78415 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX3P78415 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX3P78415 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX3P78415 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IRX3P78415 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX3P78415 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX3P78415 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX3P78415 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX3P78415 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX3P78415 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX3P78415 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX3P78415 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IRX3P78415 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IRX3P78415 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRX3P78415 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX3P78415 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX3P78415 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX3P78415 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IRX3P78415 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX3P78415 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IRX3P78415 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX3P78415 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX3P78415 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX3P78415 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX3P78415 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IRX3P78415 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms