Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEP78395 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEP78395 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEP78395 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEP78395 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEP78395 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms