Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTG1P63261 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTG1P63261 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTG1P63261 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTG1P63261 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTG1P63261 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms