Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27AP62979 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27AP62979 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27AP62979 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27AP62979 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms