Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL23P62829 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL23P62829 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL23P62829 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL23P62829 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL23P62829 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL23P62829 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL23P62829 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL23P62829 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL23P62829 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL23P62829 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL23P62829 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL23P62829 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL23P62829 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL23P62829 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL23P62829 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL23P62829 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL23P62829 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL23P62829 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL23P62829 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL23P62829 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL23P62829 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL23P62829 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL23P62829 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL23P62829 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL23P62829 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL23P62829 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL23P62829 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL23P62829 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL23P62829 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL23P62829 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL23P62829 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL23P62829 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL23P62829 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL23P62829 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL23P62829 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL23P62829 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL23P62829 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL23P62829 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL23P62829 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL23P62829 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL23P62829 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL23P62829 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL23P62829 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL23P62829 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23P62829 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23P62829 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23P62829 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23P62829 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23P62829 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23P62829 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23P62829 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23P62829 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23P62829 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23P62829 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23P62829 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23P62829 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23P62829 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23P62829 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23P62829 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23P62829 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23P62829 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23P62829 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23P62829 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23P62829 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23P62829 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23P62829 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23P62829 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23P62829 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23P62829 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23P62829 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23P62829 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23P62829 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23P62829 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23P62829 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23P62829 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23P62829 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23P62829 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23P62829 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL23P62829 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23P62829 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23P62829 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23P62829 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23P62829 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23P62829 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23P62829 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23P62829 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23P62829 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23P62829 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23P62829 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23P62829 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23P62829 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23P62829 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL23P62829 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms