Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMC6P62333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMC6P62333 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMC6P62333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMC6P62333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMC6P62333 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMC6P62333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PSMC6P62333 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSMC6P62333 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSMC6P62333 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSMC6P62333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC6P62333 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSMC6P62333 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms