Protein–RNA interactions for Protein: P61925

PKIA, cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIAP61925 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKIAP61925 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKIAP61925 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKIAP61925 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKIAP61925 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKIAP61925 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKIAP61925 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKIAP61925 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKIAP61925 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKIAP61925 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKIAP61925 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKIAP61925 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKIAP61925 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKIAP61925 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKIAP61925 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKIAP61925 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKIAP61925 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKIAP61925 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKIAP61925 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKIAP61925 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKIAP61925 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKIAP61925 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKIAP61925 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKIAP61925 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKIAP61925 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKIAP61925 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKIAP61925 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKIAP61925 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKIAP61925 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKIAP61925 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKIAP61925 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKIAP61925 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKIAP61925 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKIAP61925 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKIAP61925 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKIAP61925 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKIAP61925 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKIAP61925 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKIAP61925 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKIAP61925 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKIAP61925 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKIAP61925 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKIAP61925 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKIAP61925 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKIAP61925 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKIAP61925 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKIAP61925 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKIAP61925 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKIAP61925 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKIAP61925 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKIAP61925 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKIAP61925 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKIAP61925 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKIAP61925 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKIAP61925 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKIAP61925 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKIAP61925 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKIAP61925 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKIAP61925 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKIAP61925 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKIAP61925 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKIAP61925 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKIAP61925 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKIAP61925 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKIAP61925 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKIAP61925 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKIAP61925 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKIAP61925 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKIAP61925 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKIAP61925 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKIAP61925 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKIAP61925 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKIAP61925 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PKIAP61925 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKIAP61925 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKIAP61925 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKIAP61925 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKIAP61925 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKIAP61925 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKIAP61925 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKIAP61925 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKIAP61925 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKIAP61925 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKIAP61925 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKIAP61925 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKIAP61925 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKIAP61925 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKIAP61925 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKIAP61925 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKIAP61925 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKIAP61925 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKIAP61925 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKIAP61925 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms