Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOAP61586 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOAP61586 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOAP61586 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOAP61586 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOAP61586 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOAP61586 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOAP61586 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOAP61586 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOAP61586 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOAP61586 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOAP61586 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOAP61586 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOAP61586 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOAP61586 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOAP61586 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOAP61586 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOAP61586 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOAP61586 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOAP61586 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOAP61586 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOAP61586 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOAP61586 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOAP61586 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOAP61586 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOAP61586 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOAP61586 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOAP61586 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOAP61586 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOAP61586 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOAP61586 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOAP61586 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOAP61586 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOAP61586 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOAP61586 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOAP61586 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOAP61586 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RHOAP61586 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOAP61586 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOAP61586 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOAP61586 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOAP61586 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOAP61586 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOAP61586 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOAP61586 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOAP61586 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOAP61586 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOAP61586 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOAP61586 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOAP61586 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOAP61586 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOAP61586 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOAP61586 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOAP61586 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOAP61586 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOAP61586 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOAP61586 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOAP61586 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOAP61586 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOAP61586 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOAP61586 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOAP61586 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOAP61586 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOAP61586 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOAP61586 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOAP61586 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOAP61586 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOAP61586 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOAP61586 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOAP61586 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOAP61586 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOAP61586 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOAP61586 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOAP61586 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOAP61586 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOAP61586 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOAP61586 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOAP61586 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOAP61586 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOAP61586 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOAP61586 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOAP61586 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOAP61586 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOAP61586 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOAP61586 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOAP61586 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOAP61586 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOAP61586 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOAP61586 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOAP61586 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOAP61586 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOAP61586 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOAP61586 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOAP61586 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOAP61586 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOAP61586 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOAP61586 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOAP61586 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOAP61586 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RHOAP61586 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms