Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROK1P58294 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROK1P58294 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROK1P58294 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROK1P58294 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROK1P58294 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROK1P58294 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROK1P58294 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROK1P58294 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROK1P58294 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROK1P58294 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROK1P58294 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROK1P58294 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROK1P58294 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROK1P58294 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PROK1P58294 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROK1P58294 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PROK1P58294 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PROK1P58294 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROK1P58294 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROK1P58294 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROK1P58294 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROK1P58294 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROK1P58294 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROK1P58294 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROK1P58294 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROK1P58294 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROK1P58294 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PROK1P58294 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROK1P58294 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROK1P58294 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROK1P58294 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROK1P58294 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PROK1P58294 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PROK1P58294 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROK1P58294 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PROK1P58294 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PROK1P58294 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PROK1P58294 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PROK1P58294 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PROK1P58294 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PROK1P58294 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PROK1P58294 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PROK1P58294 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PROK1P58294 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PROK1P58294 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PROK1P58294 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PROK1P58294 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PROK1P58294 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PROK1P58294 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PROK1P58294 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PROK1P58294 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PROK1P58294 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PROK1P58294 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PROK1P58294 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PROK1P58294 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PROK1P58294 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PROK1P58294 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PROK1P58294 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PROK1P58294 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PROK1P58294 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PROK1P58294 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PROK1P58294 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PROK1P58294 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PROK1P58294 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PROK1P58294 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PROK1P58294 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PROK1P58294 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PROK1P58294 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PROK1P58294 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PROK1P58294 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PROK1P58294 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PROK1P58294 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PROK1P58294 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PROK1P58294 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PROK1P58294 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PROK1P58294 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PROK1P58294 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PROK1P58294 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PROK1P58294 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PROK1P58294 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PROK1P58294 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PROK1P58294 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PROK1P58294 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PROK1P58294 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PROK1P58294 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PROK1P58294 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PROK1P58294 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PROK1P58294 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PROK1P58294 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PROK1P58294 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PROK1P58294 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PROK1P58294 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PROK1P58294 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms