Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PEX3P56589 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PEX3P56589 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PEX3P56589 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PEX3P56589 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PEX3P56589 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PEX3P56589 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PEX3P56589 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PEX3P56589 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PEX3P56589 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PEX3P56589 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PEX3P56589 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PEX3P56589 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PEX3P56589 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX3P56589 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX3P56589 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX3P56589 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX3P56589 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX3P56589 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX3P56589 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX3P56589 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX3P56589 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX3P56589 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PEX3P56589 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PEX3P56589 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX3P56589 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX3P56589 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX3P56589 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX3P56589 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX3P56589 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX3P56589 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX3P56589 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX3P56589 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX3P56589 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PEX3P56589 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX3P56589 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX3P56589 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX3P56589 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX3P56589 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX3P56589 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PEX3P56589 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PEX3P56589 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PEX3P56589 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX3P56589 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX3P56589 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX3P56589 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX3P56589 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX3P56589 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX3P56589 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PEX3P56589 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX3P56589 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX3P56589 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX3P56589 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX3P56589 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX3P56589 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX3P56589 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX3P56589 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX3P56589 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PEX3P56589 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PEX3P56589 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PEX3P56589 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PEX3P56589 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX3P56589 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX3P56589 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX3P56589 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX3P56589 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX3P56589 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX3P56589 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX3P56589 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PEX3P56589 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX3P56589 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX3P56589 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX3P56589 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PEX3P56589 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PEX3P56589 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PEX3P56589 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PEX3P56589 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PEX3P56589 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PEX3P56589 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PEX3P56589 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PEX3P56589 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PEX3P56589 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PEX3P56589 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PEX3P56589 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PEX3P56589 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PEX3P56589 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PEX3P56589 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PEX3P56589 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PEX3P56589 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PEX3P56589 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PEX3P56589 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PEX3P56589 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PEX3P56589 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PEX3P56589 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PEX3P56589 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PEX3P56589 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PEX3P56589 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PEX3P56589 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PEX3P56589 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PEX3P56589 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms