Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAV3P56539 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAV3P56539 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAV3P56539 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAV3P56539 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAV3P56539 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAV3P56539 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAV3P56539 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAV3P56539 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAV3P56539 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAV3P56539 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAV3P56539 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAV3P56539 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAV3P56539 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAV3P56539 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAV3P56539 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAV3P56539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAV3P56539 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAV3P56539 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAV3P56539 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAV3P56539 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAV3P56539 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAV3P56539 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAV3P56539 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAV3P56539 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAV3P56539 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAV3P56539 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAV3P56539 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAV3P56539 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAV3P56539 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAV3P56539 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAV3P56539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAV3P56539 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAV3P56539 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAV3P56539 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAV3P56539 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAV3P56539 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAV3P56539 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAV3P56539 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAV3P56539 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAV3P56539 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAV3P56539 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV3P56539 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV3P56539 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV3P56539 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV3P56539 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV3P56539 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV3P56539 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV3P56539 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV3P56539 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV3P56539 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV3P56539 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV3P56539 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV3P56539 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV3P56539 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV3P56539 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAV3P56539 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV3P56539 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV3P56539 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV3P56539 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV3P56539 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV3P56539 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV3P56539 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV3P56539 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV3P56539 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV3P56539 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV3P56539 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV3P56539 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV3P56539 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV3P56539 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV3P56539 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV3P56539 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV3P56539 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAV3P56539 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAV3P56539 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV3P56539 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV3P56539 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV3P56539 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV3P56539 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV3P56539 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV3P56539 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV3P56539 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV3P56539 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV3P56539 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV3P56539 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV3P56539 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV3P56539 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV3P56539 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV3P56539 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV3P56539 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV3P56539 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV3P56539 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV3P56539 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms